1. 国家自然科学基金项目，尺寸控制基因调控序列在鲤科鱼类中的变异及系统演化，30770299，2008.01-2008.12，孔祥会，已结项
2. 国家自然科学基金委-河南省联合基金项目，草鱼pIgR受体结合和转运IgM的分子机制研究，U1604104，2017.01-2019.12，孔祥会，已结项
3. 国家自然科学基金面上项目，鲤IL-17B在肠道炎症反应中的功能及调控机制研究，32002427，2021.01-2023.12，蒋昕彧，已结项
4. 国家自然科学基金青年项目，VP41蛋白在Ⅱ型草鱼呼肠孤病毒感染过程中的作用机制研究，31602201，2017.01-2019.12，裴超，已结项
5. 国家自然科学基金青年项目，不同海拔梯度裂腹鱼类Toll样受体基因的分子进化模式研究，32300347，2024-01-01至2026-12-31，张杰，在研
6. 国家自然科学基金青年项目，鲤线粒体自噬通路PINK1-Parkin响应SVCV感染的调控机制研究，32303056，2024-01至2026-12，李趁，在研
7. 国家自然科学基金青年项目，鲤GSDMEs诱导细胞焦亡过程中触发线粒体膜损伤和功能障碍的分子机制研究，32403065，2025-01-01至2027-12-31，赵燕静，在研