张猛副教授作为第一作者，乔志刚教授和申亚伟博士为共同通讯作者。

原文链接：https://www.nature.com/articles/s41597-026-07104-7

DOI：https://doi.org/10.1038/s41597-026-07104-7

内容简介

花䱻（Hemibarbus maculatus Bleeker, 1871）是一种广泛分布于东亚地区长江至黑龙江流域的中小型底栖鱼类，是我国淡水经济鱼类之一。本研究结合PacBio单分子测序技术和高通量染色体构象捕获技术，成功构建了花䱻的高质量染色体水平基因组。最终组装基因组大小为1098.66 Mb，contig N50达33.57 Mb，scaffold N50为40.40 Mb。我们将基因组锚定到25条染色体上，其总长度占基因组的97.49%，BUSCO评估显示基因组完整性达95.64%。此外，还鉴定出285.16 Mb（25.96%）的重复序列和23233个预测基因，其中23021个基因获得功能注释（Swiss-prot、NR、TrEMBL、Pfam、GO和KEGG），占预测基因总数的99.09%。这些结果为花䱻的遗传、进化及生物学特性研究提供了重要的基因组资源。

数据下载

Hifi原始数据：https://ngdc.cncb.ac.cn/gsa/browse/CRA028615

Hi-C原始数据：https://ngdc.cncb.ac.cn/gsa/browse/CRA028617

Short-reads数据（二代DNA和RNA数据）：https://ngdc.cncb.ac.cn/gsa/browse/CRA028635

基因组组装序列：https://ngdc.cncb.ac.cn/gwh/Assembly/98818/show

基因组组装序列及注释文件（即将公开）：https://doi.org/10.6084/m9.figshare.31361515