教授

李书粉

发布时间:2023-04-03






姓名:   李书粉

职称:教授、博士生导师

办公电话:18303638280

电子邮箱:lishufen83@163.com








个人简介:

   博士,教授,博士生导师,河南省优秀青年科学基金获得者,河南省高校科技创新人才,河南省高校青年骨干教师。主要从事植物性别决定及分化、植物性染色体起源及演化的细胞及表观学机制研究;先后主持国家自然科学基金2项、河南省自然科学基金优秀青年基金和面上项目各一项、河南省高校科技创新人才项目1项、河南省高校重点科研项目2项,参加国家自然科学基金面上项目3项;在《Horticulture Research》、《Mobile DNA》、《BMC Plant Biology》、《Planta》等SCI期刊发表学术论文20余篇;承担本科生和研究生《普通遗传学》、《生物信息学》和《染色体技术与方法概论》等多门课程。

研究领域:

1. 植物性别决定及分化机制

2. 植物性染色体起源及演化的细胞及表观遗传学机制

3. 植物基因组结构与功能演化

主持或参加科研项目情况:

1. 基于单染色体测序的啤酒花X染色体性别决定区的组装及性别决定候选基因的鉴定(32170336),国家自然科学基金面上项目,58万元,主持,2022. 1-2025.12。

2. 基于性染色体特异反转座子分析的石刁柏性染色体演化研究(31300202),国家自然科学基金青年基金, 23万元,主持,2014.1-2016.12。

3. 基于比较基因组学分析的石刁柏性染色体演化研究(222300420053),河南省自然科学基金优秀青年基金,25万元,主持,2022.1-2024.12。

4.天门冬属植物性别决定基因结构与功能演化研究(23HASTIT035),河南省高校科技创新人才支持计划,30万元,主持,2023.1-2025.12.

5. 石刁柏性染色体NUPTs的分离鉴定及其对性染色体的表观干扰作用 (202300410242),河南省自然科学基金面上项目,10万元,主持,2020.1-2021.12。

6. 雌雄异株植物石刁柏Y染色体特异转座子的分离与坚定(13A180525),河南省高等学校重点科研项目,2万元,主持,2013.1-2014.12。

7. 芦笋核质体DNA对其性染色体结构的表观干扰作用(19A180003),河南省高等学校重点科研项目,5万元,主持,2019.1-2020.12。

8. 基于LTR类反转座子的天门冬属植物性染色体起源及演化的分子细胞学路径解析(31970240),国家自然科学基金项目(面上),58万元,参加,2020.1-2023.12。

9. 石刁柏Y染色体Ty1-copia反转座子分离及其激发Y染色体异染色质化的表观修饰机制解析(31470334),国家自然科学基金项目(面上),80万元,参加,2015.1-2018.12。

10. 菠菜Y染色体雄性特异区域(MSY)的克隆及性别决定候选基因的功能鉴定(31770346),国家自然科学基金项目(面上),60万元,参加,2018.1-2021.12。

10.动植物性别决定及分化机制研究(17IRTSTHN017), 河南省高校科技创新团队, 100万元, 参加, 2017.1-2018.12。

学术成果:

代表性论文:

1. Li SF, Zhang XY, Yang LL, Jia KL,Li JR, Lan LN, Zhang YL, Li N, Deng CL, Gao WJ*. Landscape and evolutionary dynamics of Helitron transposons in plant genomes as well as construction of online database HelDB. J Syst Evol,2022, https://doi.org/10.1111/jse.12929

2. You C, Wen RD, Zhang ZL, Cheng GQ, Zhang YL, Li N, Deng CL, Li SF*, Gao WJ*. Development and applications of a collection of single copy gene-based cytogenetic DNA markersin garden asparagus. Front Plant Sci,2022, 13: 1010664.

3. Li SF, She HB, Yang LL, Lan LN, Zhang XY, Wang LY, Zhang YL, Li N, Deng CL, Qian W*, Gao WJ*. Impact of LTR-retrotransposons on genome structure, evolution, and function incurcurbitaceae species. Int J Mol Sci,2022, 23: 10158.

4. Li SF, Lv CC, Lan LN, Jiang KL, ZhangYL, Li N, Deng CL, Gao WJ*. DNA methylation is involved in sexual differentiation and sex chromosome evolutionin the dioecious plant garden asparagus. Hortic Res, 2021, 8, 198.

5.Li SF, Wang J, Dong R, Zhu HW, Lan LN, Zhang YL, Li N, Deng CL, Gao WJ*.Chromosome-level genome assembly, annotation and evolutionary analysis of the ornamental plant Asparagus setaceus.Hortic Res, 2020, 7:48.

6. Li SF, Li JR, Wang J, Dong R, Jia KL, Zhu HW, Li N, Yuan JH, Deng CL, Gao WJ*.Cytogenetic and genomic organization analyses of chloroplast DNA invasions in the nuclear genome of Asparagus officinalis L. provides signatures of evolutionary complexity and informativity in sex chromosome evolution. BMC Plant Biol,2019, 19(1): 361.

7. Li SF, Guo YJ, Li JR, Zhang DX, Wang BX, Li N, Deng CL*, Gao WJ*. The landscape of transposable elements and satellite DNAs in the genome of a dioecious plant spinach (Spinacia oleracea L.).Mobile DNA, 2019, 10: 3.

8. Li SF, Zhang GJ, Zhang XJ, Yuan JH, Deng CL, Gu LF, Gao WJ*. DPTEdb, an integrative database of transposable elements in dioecious plants. Database, 2016:baw078.

9. Li SF, Zhang GJ, Zhang XJ, Yuan JH, Deng CL, Gao WJ*. Comparative transcriptome analysis reveals differentially expressed genes associated with sex expression in garden asparagus (Asparagus officinalis). BMC Plant Biol,2017, 17(1):143-158.

10. Li SF, Zhang GJ, Yuan JH, Deng CL, Gao WJ*.Repetitive sequences and epigenetic modification: inseparable partners play important roles in the evolution of plant sex chromosomes. Planta, 2016, 243(5): 1083-1095.

11. Li SF, Su T, Cheng GQ, Wang BX, Li X, Deng CL, Gao WJ*. Chromosome evolutionin connection with repetitive sequences and epigenetics in plants. Genes, 2017, 8(10): 290-308.

12. Li SF, Gao WJ*, Zhao XP, Dong TY, Deng CL, Lu LD. Analysis of transposable elements in the genome of Asparagus officinalis from high coverage sequence data. PLoS One, 2014, 9(5): e97189.

13. Li SF, Zhang GJ, Li X, Wang LJ, Yuan JH, Deng CL, Gao WJ*. Genome-wide identification and validation of simple sequence repeats (SSRs) from Asparagus officinalis. Mol Cell Probe, 2016, 30(3): 153-160.

14. Li SF, Wang BX, Guo YJ, Deng CL, Gao WJ*. Genome-wide characterization of microsatellites and genetic diversity assessment of spinach in the Chinese germplasm collection. Breed Sci,2018, 68: 455-464.

专利成果:

1. 高武军, 李书粉, 王连军, 张国俊, 邓传良, 卢龙斗. 一种鉴别葎草性别的分子生物学方法. ZL201310548829.0, 2015.4.15 (授权)

2. 高武军, 李书粉, 侯翠翠, 袁金红, 邓传良. 石刁柏染色体荧光原位杂交的着丝粒标记及其应用. ZL201610314188.6, 2019.7.12 (授权)