5月17日上午，河南大学数学与统计学院王沛教授应邀在河南师范大学数学与统计学院（密码学院）作题为“从算法到生物学发现：k-shape聚类增强的组Lasso方法鉴定油菜盐胁迫关键基因”的学术报告。数学与统计学院（密码学院）师生共二十余人参加此次报告。报告由数学与统计学院（密码学院）李钧涛教授主持。
报告中，王沛教授围绕高维转录组数据中关键基因识别的计算方法问题展开深入讲解。他首先介绍了传统方法在处理高维相关数据时面临的挑战，提出了一种将k-shape聚类引入组Lasso逻辑回归的GLKSH方法。该方法在准确性和鲁棒性上优于传统k-means变体，能够实现更优的基因选择与样本分类。
王教授进一步将该方法应用于油菜盐胁迫转录组数据，从39,330个差异表达基因中成功鉴定出346个关键基因。这些基因呈现出高度动态的时空特异性表达模式，其中23个基因可区分叶片与根系，187个基因主导盐胁迫下叶片发育，144个基因主导根系发育。关键基因中包含众多应激响应转录因子，差异共表达网络分析揭示盐胁迫诱导了SOS信号通路相关基因的广泛共表达变化。过表达验证表明，识别出的BnaC07g40860D基因显著增强了油菜耐盐性。
本次报告内容丰富、视角前沿，既有算法理论深度又有生物学应用价值，拓宽了师生们在计算系统生物学与基因选择领域的研究视野，现场交流气氛热烈，取得了良好的学术交流效果。
专家简介：
王沛，河南大学教授、博导；河南省特聘教授、省杰青、优青科学基金获得者、省高校科技创新人才等。主要研究方向为计算系统生物学、生物统计学、网络生物学、复杂网络等。出版Springer专著1部，在IEEE会刊, IEEE J. Biomed. Health Informat., Brief. Bioinformat., Plant Physiol. Biochem.等上发表论文70余篇。主持国家自然科学基金面上(2项)、青年以及省级等各类项目10余项; 以第一完成人获省科技进步奖三等奖1项、教育厅科技成果奖一等奖3项和论文奖一等奖14项、市青年科技奖1项等。曾为澳大利亚RMIT访问学者，香港城市大学研究助理。为IEEE Senior Member，美国数学评论评论员；任复杂网络与复杂系统、数学生命科学、生物信息学与人工生命, 网络科学与工程4个专委会委员。任SCI期刊IET Systems Biology的Associate Editor,《数学季刊》（英文版）编辑部执行副主任、省工业互联网工程技术研究中心副主任、Gene & Protein in Disease编委、CSIAM通讯编委等。
（数学与统计学院（密码学院）李钧涛）
最新通知